元勋臣开元王纳哈出及辽王阿札失里降明之后，当被成吉思汗分封在蒙古东部的诸王除了这部分降明的外，还有一部分被崛起的蒙古本部（即鞑靼）实权人物阿鲁台所吞并。明永乐初，在蒙古草原与明朝对抗的剩有蒙古本部及瓦剌。

永乐七年，蒙古瓦剌部投靠了明廷，成为了明朝的藩属。这时候的蒙古本部立了一位名叫本雅失里的新大汗，永乐八年，明成祖率领五十万众出塞，大败蒙古本雅失里汗于斡难河（斡难河者，元太祖始兴地也），本雅失里仅七骑渡河遁去。西奔的本雅失里在二年后被瓦剌马哈木等杀了。

就在本雅失里汗被杀之前，蒙古本部的阿鲁台已经数次入贡。（据《明实录》永乐八年十二月丁未条记载，永乐九年<1411>一月，阿鲁台遣使到明朝，称：“元氏子孙已绝，欲率部属来归”，当时本雅失里尚未死，阿鲁台就已经决定抛弃这位傀儡，投靠明朝。同年十二月入贡。）

在永乐八年至永乐八年这一段时间，原先的蒙古可汗本雅失里败死，蒙古各部处于无主状态。但是鉴于瓦剌的最高掌权者马哈木、太平、秃孛罗和蒙古本部的最高掌权者阿鲁台已经先后向明成祖称臣朝贡，而且由蒙古西北诸汗国派生出的东察合台汗国和贴木儿帝国亦已经明朝称臣朝贡，因此不管当时所有的蒙古人是否乐意，这一刻的明朝几乎已经全盘接收了昔日蒙古大帝国（包括元朝、窝阔台汗国、察合台汗国、伊儿汗国、钦察汗国等）的所有遗产。