究竟发生了什么事，使得主人仓促间离开了这里，还抱着重返的念头？他们为什么并没有返回？

　　遗址出土的木简中中曾反复提到苏毗人的侵略，称苏毗人性情悍勇，经常攻击精绝州，威胁着它的安全。鄯善国王为此颁布了很多命令，令精绝州的管理者们注意警戒。可见，这里的战争是经常发生的。那么，是不是突如其来的战争使这片绿洲被废弃，使精绝人被迫迁徙到其它地方？

　　这种情况是可能的。但是，既然是有组织的撤退，为什么撤退了的人们没有带走重要的官方文书呢？而且，在尼雅遗迹中，没有断戟残剑沉埋沙中，也没有白骨遍野的战争痕迹，所有出土的古尸，都是平静面又安详的，大礼安葬，陪葬物丰富。他们的墓葬，尽显太平盛世的风貌。所有的房屋遗址，都是完整的。它们排列整齐地坐落在那里，平静面又安详，仿佛它们的主人没有走远，烟炊当再次升起，牛羊会再次撒欢，尼雅孩子们的笑声会再次弥漫在大街小巷、村庄院落。如果说精绝是毁于战争，又该如何解释这不合理的一切呢？

　　也有人说，精绝可能是毁于自然条件的恶化。尼雅遗址在民丰县尼雅河流域北边，而尼雅河当时属于塔克拉玛干沙漠地区一条中型河流，从昆仑山上流淌下来的雪水孕育着尼雅河流域三角绿洲，成为西域精绝国得以世代繁衍的依托。西域的气候异常干燥，沙漠花的进程非常迅速，而其中的河流也经常改道或者消失。如果养育精绝州的尼雅河改变了流向，或者水量减少，如果风沙干扰了精绝人的生活，那么，精绝人确实可能放弃曾经世代生活的土地。

　　《汉书·西域传》称精绝国“泽地湿热，难以履涉，芦苇茂密，无复途径”，这样的地方很难住人，绝不会是精绝国人当初定居时的羊毛，可见当时精绝国环境已十分险恶。在出土的佉卢文木简中也发现了这样的条款：“砍伐活树，罚一匹马，砍伐树杈，罚母牛一头。”精绝国开始用法律手段保护树木，可见树的重要性越来越高了。这是不是暗示着尼雅绿洲的生态已经开始恶化？精绝国的废弃会不会与自然条件的逐渐恶化有关？

　　如果水源仍在，沙漠化的进程就会收到遏制。精绝人如果面临干旱威胁，就必然与尼雅河的变化有关。因素可能有两个，一是河流改道，二是河的上流出现大规模的其它居民聚居点，对河水消耗大增。但现在人们并没有在尼雅遗址周围找到关于尼雅河大规模改道的证据，同时也并未在尼雅河上游发现任何人类聚居点的遗迹。另外，在尼雅遗址里，不少住宅周围都有巨树环绕，树干粗大至一人不能合抱，果园中林木整齐。桑木排列整齐，不少为数十年之巨桑。住处附近从堆积的淤泥看，还有水塘的痕迹。在这样好的生存环境中，很难说尼雅河会突然断流，导致精绝王国覆灭。即便是由于环境恶化，精绝举国迁移。可是，为什么没有开封的各类文书还整齐地放置在屋内墙壁旁？如果是因为环境的改变而搬迁，精绝人就更没有理由丢弃下官方的文件落荒而逃了。