首先是徐福故里在哪里，也就是说徐福是哪里的人？在《史记》里，司马迁把徐福记为“齐人”。由于“齐”是一个历史概念和广义的地域概念，它既包括战国时的“齐国”，也包括“齐地”的含义，同时还包括秦朝的“齐郡”含义，因此引发了一场旷日持久的徐福故里之争。根据史书对“齐国”、“齐地”、“齐郡”的界定，史学家提出如下推测：如果“齐人”之齐是指齐国，则现在的赣榆、琅琊、黄县（今龙口市）等都包括在内；如果只指齐地人，则赣榆就被排除之外，而只包括琅琊、黄县等；如果是指齐郡，则琅琊也被排除。

其二是秦始皇为何支持徐福东渡。《史记》上说，秦始皇不惜以巨资支持徐福东渡，是为了寻神山仙药，求长生不死药。但是，史学界有人认为，上述看法可理解，但是派遣徐福东渡的真正目的是“以示强威，服海内”。还有的认为，支持徐福东渡的目的是寻找先人的足迹。秦始皇认为自己是赢族的后代，所以派人去瀛洲寻根。

其三是徐福的船队从哪里启航？关于这一点的主要说法有：河北省的秦皇岛和黄骅附近说，浙江省慈溪和舟山说，江苏省海州一带（现在的连云港赣榆县）说，山东省登州湾（龙口市黄县）及胶州湾徐山（青岛）琅琊、成山头说。

其四是徐福东渡到达何方。多数学者认为，徐福到达的三神山不是什么海市蜃楼，而是指日本列岛。还有的认为，可能去的是吕宋岛。还有的认为是去海南岛等等。

其五是谁是徐福的后裔。现在一些日本人说自己是徐福的后裔的理由是，在日语中，秦与羽田的发音相同。前日本首相羽田就称自己是徐福的后裔。还有的人认定徐福即日本的神武天皇。

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