明末时期，吏治败坏，在任用官员问题上尤为突出，发生过一系列丑闻和几乎令人难以置信的奇闻。例如某些被罢黜并系狱究办的大员，必须行贿，方能进入监房坐牢，即出现于此时。
        崇祯初，朝中京官或地方主官出缺，除循例由新进士中选拔外，也由任过一定时期的州县官吏中进行考选。这就给某些朝臣，大开了发财之门。
        考选标准并非根据德、才，而是徇私枉法。譬如礼部郎中路迈，只因为和大学士周廷儒的弟弟周正仪是儿女亲家，依仗这个关系，竟订出“七千求词林(翰林官)、五千求科(给事中)、三千求道(监察御史)”的价格，公开受贿，代人走门路求官。如果没有把握，路迈岂敢公然如此?朝中层层勾结、徇私舞弊的内幕，由此不难窥见。
        进京接受考选的官吏，为了攫取肥缺美缺，无不争相向当权者施贿。授官大权由吏部掌握。东厂为了分肥，常对该部的舞弊行为提出弹劾。因此，每遇考选的年头，吏部官员惴惴不安。后来双方协议，每次选官，由吏部送银二万两给厂监，听由该部寻找谋缺的人，从此才相安无事。
        崇祯十年三月出任吏部尚书的田唯嘉，为掌握内外情况，曾向宫内太监普遍送礼，要求互通消息。次年，被御史参劾“考选不公”，而劾本内容他很快便知道了，于是匆忙上疏自辩。谁知谏官们认为，御史的奏疏送入内廷，尚未公开，田唯嘉何以得知其情由，再度提出纠劾。皇帝为宫中泄密一事感到恼火，传旨令锦衣卫镇抚司究办，先逮捕了田家的四名亲信。田唯嘉心中惧怕，只得把到手的贿金大部份送给镇抚司，但后来还是被罢了官。事情外传后，民间曾讥讽说：“吏部囊空，锦衣地重!”
        作为执法主管机构之一的刑部，同样是黑幕重重的浑水衙门。崇祯十二年升任该部尚书的甄淑，表面上道貌岸然，一介不取。但却听任儿子贪赃枉法制造了许多冤案。次年他因故下狱，囚禁狱内的受害人一见到他，立刻蜂涌而上，予以痛殴。狱官叶国华恐怕他被揍死，只好把他关在狱吏室内，使冤愤者不能近身。
       任用大员也存在问题，皇帝往往凭印象出发，决定尚书、侍郎人选。在内外交困之际，这些人常获咎于皇帝，被当廷传旨系狱。崇祯十二年五月擢升兵部尚书的傅宗龙，年底即以“戏视封疆”，由朝房直接下狱。