当时瓯、闽间有一条狭长的地域叫谈洋，该地区是盐贩、盗贼聚集的地方，方国珍便是从这起兵反叛的。刘基委托儿子刘琏上奏，建议应在该地区设立巡检司以控制管辖该地，使那里的刁民无机可乘，不能互相勾结或胁迫戍边士兵一道出逃反叛。胡惟庸使刑部尚书吴云弹刻刘基，反指淡洋踞山临海，有君王之气．刘基想要谋取作为自己的墓地，当地百姓不答应，便想要在那里设置巡检司为难当地民众，才导致该地区形势迅速恶化。朱元璋不置可否，只是命令下传此文让刘伯温知晓。这是一个明确的信号，也是一种胁迫，如果没有合适的反应，谋反的罪名就会临头。刘伯温于是只好赴京亲自上朝拜见朱元璋，但朱元璋又全然不过问此事，刘伯温既不能辨白，又不敢离京。不久便发病了。此时胡惟庸携带补药前来探望病情。刘基吃了胡惟庸拿来的药后，顿时感到有如拳头大小的石头般的硬物堵塞在胸口。刘基又利用空闲时间奏明了朱元璋．朱元璋依旧不过问。又过了三个月，病情更加恶化。朱元璋派人前去问候刘基，得知他已不能起床了，便让他乘坐传送公文的船返回青田家乡。不久后，一代绝世奇才便这样去世了。毒杀刘基，这是后来胡惟庸的一大罪状，但下毒是否为朱元璋的授意，已成悬疑。不过这出自朱元璋的授意可能性极大。首先，刘基死于洪武八年四月，胡惟庸进中书省是洪武六年七月，那时胡入相时间不长，地位并不稳固，还处在“考察期”，又有汪广洋牵制，未必能够胆大妄为到这个程度。胡惟庸虽然嫉恨刘伯温，但并无深仇大恨，弹刻刘基的奏章也强词夺理，没有能令人信服依据，如果没有来自皇帝方面的一些默许，本身就有诬告嫌疑，很可能反过来惹火上身。更何况刘伯温已归隐，不可能对其地位权势构成威胁，做下毒这种风险很大而毫无回报的事，对身居丞相高位，且以精明干练著称的胡惟庸而言，应该还不至于笨到这个程度。再者，不露痕迹地毒杀功臣是朱元璋的拿手绝技，李文忠、徐达也是这样因病受到探望和赠药之后便不明不白的死掉的。关于李文忠之死，《明史》载：“十六年冬遂得疾。帝亲临视，使淮安侯华中护医药。明年三月卒，年四十六。”当然，淮安侯也逃不过抄家灭门的命运。至于徐达，“达在北平病背疽，稍愈，帝遣达长子辉祖赍敕往劳，寻召还。明年二月，病笃，遂卒，年五十四。”野史说，这是拜朱元璋的一只蒸鹅所赐。此外，与胡惟庸同为丞相汪广洋因否认胡惟庸毒杀了刘伯温，在贬责途中被赐毒而死。刘伯温之死仅仅是一个开始。五年之后，大清算终于来了。始于追查他的死因的胡惟庸案发生于的洪武十三年，最终的罪名则是不可饶恕的谋反。“词所连及，坐诛者三万余人”，实际数目远高于此，因为被杀的都是以家族为单位，杀一人也就是杀一家。坐胡案死的有李善长、朱亮祖二国公二十列侯，身为太子老师的宋濂虽免于死罪，但死于流放途中。十三年后，又有蓝玉案发生于洪武二十六年，坐蓝案死的有傅有德等一公十三侯二伯及诛连被杀者又一万五千人。朱元璋铢杀屠戮，用恐怖手段造成了至高无上，森严可怖的皇权。为朱姓江山的永固，所摧残的不仅仅是功臣的性命，更有国家民族的元气和活力。