淝水之战后，前秦内部的矛盾倾刻间暴露无遗。慕容垂摆脱苻坚称王，姚苌亦叛前秦，并于385年追杀苻坚。394年，前秦灭亡，北方重新陷入分裂。慕容权贵相继回到关东，前后建立起后燕、西燕、南燕和北燕。在关中先后有羌族姚氏建立的后秦和匈奴铁弗氏建立的大夏。在陇右河西走廊先后出现了氐族吕氏建立的后凉、鲜卑乞伏部建立的西秦、鲜卑秃发部建立的南凉、汉人李嵩建立的西凉和卢水胡沮渠部建立的北凉。总共有十一个政权先后建立。直到北魏挺进中原，才结束了这一混战割据的局面。在东晋，谢安功高遭忌，被迫让权司马道子，道子毫无才能，昏愦已极，东晋政权重新陷入党争混乱，先后有王恭、殷仲堪之乱，又有孙恩，卢循的农民起义，403年桓玄自立又很快覆亡，到420年，刘裕废晋帝登基，东晋灭亡。中国南方进入宋齐梁陈的南朝时期。