明洪武十五年（1382）四月，朱元璋废除仪鸾司，改设锦衣卫，作为皇帝侍从的军事机构。锦衣卫建立前的仪鸾司不过是替皇帝掌理仪仗的普通侍卫机构，改为锦衣卫后，权力大增。除掌管侍卫职权外，还有巡察缉捕和审理诏狱的权力，实际上是明朝设立的特务组织。锦衣卫属下的镇抚司承办由皇帝命令查办的案件，他们用刑极为残酷，痛楚往往十倍于官刑。魏忠贤掌管锦衣卫时，又设断脊、堕指、刺心、“琵琶”等酷刑。这种对犯人严刑逼供、非法凌虐的做法，导致民情激愤、怨声载道。洪武二十年(1387)，朱元璋不得不下令焚毁锦衣卫刑具，所押囚犯转交刑部审理；同时下令内外狱全部归三法司审理，废除了锦衣狱。但到了明成祖时期，锦衣卫又得以恢复，并由北镇司专门处理诏狱。锦衣卫除拥有诸多特权外，还拥有大量田地，直到成化年间，他们的权势地位和有所削弱。